400 ans après la chute de la civilisation moderne, dans un monde sans foi ni loi, où règne la magie, le fer et le sang, l'armée des ténèbres attaque le royaume de Meta-Licana dans le but de récupérer l'un des 4 sceaux emprisonnant Antrhax, le dieu de la destruction. Tout cela afin de pouvoir, grâce a lui, conquérir le monde. Pour pouvoir contrer cette attaque, les habitants de Meta-Licana décident d'utiliser leur dernier recours en libérant Dark Schneider, enfermé dans le corps d'un enfant appelé Lucié. Pour lever le sceau, il doit recevoir le baiser de la fille du grand mage Tia Noto Yoko. Mais Dark Schneider n'en fait qu'à sa tête, et décide de poursuivre ce qu'il avait commencé : conquérir le monde !!