Dans les montagnes du nord de Fiore se trouve le Village du Feu, où est préservée une relique d'un bleu luxuriant, la Pierre du Phénix. Confiée à une mystérieuse femme nommée Éclair, on dit qu'elle renferme le pouvoir d'un ancien phénix. Seule, elle erre à travers le pays et protège la pierre, sans se souvenir de la raison de sa garde et à peine de l'endroit où elle doit l'emporter. Après avoir rencontré la guilde des sorciers de Fairy Tail, Éclair reçoit l'offre de Natsu Dragneel et de ses amis de l'aider à percer les mystères entourant la pierre. Cependant, au milieu de leur périple, Éclair est soudainement attaquée et la pierre lui est confisquée. De ce fait, les intentions maléfiques de ressusciter le phénix flamboyant pour sa puissance incomparable sont révélées, et les sorciers de Fairy Tail se retrouvent dans une situation potentiellement funeste. Ils doivent désormais collaborer pour empêcher la résurrection du phénix et sauver le monde de la ruine.