Le monde virtuel créé par Eureka à l'intérieur du corail scub (des formes de vie intelligentes semblables à du corail)... Les habitants de ce monde virtuel sont apparus sur Terre il y a dix ans, lors de son effondrement. Depuis cette fusion à grande échelle, les humains du monde virtuel se nomment « Terre Verte » et les humains de la Terre originelle « Terre Bleue ». Ces deux mondes se sont livrés à de nombreux conflits souterrains. Finalement, Dewey Novak, un officier supérieur des Forces armées de la Terre Verte, se soulève avec ses camarades et met en œuvre un plan terroriste d'envergure pour défendre leur dignité. Pendant ce temps, Eureka, détestée de tous et considérée comme la principale responsable du chaos, est devenue une combattante d'élite au sein de l'unité A.C.I.D. de l'ONU. Elle vit pour maintenir la paix sur Terre... Tel est le chemin de la rédemption qu'elle a choisi. Un jour, elle reçoit l'ordre de protéger une jeune fille nommée Iris, une nouvelle « Eureka » capable de contrôler le corail. Leurs disputes sont fréquentes au début, mais peu à peu, leur fuite solitaire leur permet de mieux se comprendre. Bientôt, le monde est confronté à une crise, et face à elle, Eureka puise dans ses dernières forces pour se battre. « Je veux protéger Iris et ce monde. » Quel avenir l'attend une fois ce vœu exaucé ?